De peta bytes sequencing data van Project MinE zijn beveiligd opgeslagen bij SURFsara Amsterdam. Sinds September heeft SURFsara deze opslag in een gloednieuw gebouw op het Amsterdam Science Park, de Amsterdam Data Tower. SURFsara is een stichting die door middel van geavanceerde ICT-infrastructuren, -diensten en -expertise wetenschappelijk onderzoek in Nederland ondersteunt. Dankzij optimale data infrastructuur kan Project MinE efficiënt data opslaan en analyseren.